Programów do tego celu jest całkiem sporo. Wymienię tylko kilka bardziej znanych: FolderChangesView, BeeWatcher, FolderMon, Directory Monitor. Większość tego typu narzędzi działa w sposób ciągły - tj. monitorują zmiany na bieżąco, a następnie o nich informują. Jeśli chcesz wykonywać operację jednorazowo, możesz również skorzystać z aplikacji do listowania zawartości folderu (na przykład
Directory List & Print), a następnie odpalić coś do porównywania plików tekstowych (polecam
WinMerge).